しんかい6500は、 JAMSTEC（海洋研究開発機構）の日本の深海海洋調査潜水艦です。
その名前が示すように、海底6,500メートルまで到達することができます（ロシアの2隻の潜水艦ミール1とミール2とフランスのノーティルのみが海底の98％にあたる6,000メートルまで到達できます）。
「しんかい2000」に続いて打ち上げられ、1990年に建造が完了した。通常の潜水自律性は8時間（緊急自律性は5日間）で、乗組員3名を乗せることができる。大きさは9.5メートル、幅2.17メートル、高さ3.2メートルです。
1989年8月11日、「しんかい6500」は三陸沖の海溝の深さ6,527メートルに到達し、これは現役の有人潜水艦としては現在の記録である。
専用に建造された横須賀艦は、潜水艦の支援艦および作戦センターとして機能します。