導入
| 臭化エチジウム | |||
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| 一般的な | |||
| IUPAC名 | |||
| CAS番号 | 1239-45-8 | ||
| No.EINECS | 214-984-6 | ||
| 外観 | 固体: 赤茶色 溶液中: 濃度に応じて暗赤色からオレンジ色まで | ||
| 化学的性質 | |||
| 生のフォーミュラ | C 21 H 20 BrN 3 | ||
| モル質量 | 394.308 ± 0.02 g mol -1 | ||
| 物性 | |||
| 融解温度 | 511～513K（ 238 ～ 240 ℃ ） | ||
| 溶解性 | 20 °C :水50 g · l -1 、クロロホルム1.3 g · l -1 | ||
| 予防 | |||
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| Rフレーズ： 22、26、36 / 37/ 38、68、 | |||
| Sフレーズ： 26、28、36 / 37、45 、 | |||
エチジウム(同義語:ホミジウム、あまり一般的ではありませんがノビジウム、バビジウム、またはRD 1572 ) は、化学式 C 21 H 20 N 3の第 4 級アンモニウムを有する芳香族有機化合物です。概略的には、この分子は、両側でピリジン基に結合し、フェニル基で置換された 2 つのアニリン基で構成されています。
歴史的
エチジウムは、アフリカでトリパノソーマ（睡眠病の原因）による牛の感染症と闘う薬として 1950 年代に開発され、現在でもこの適応症に使用されています。 1 mg・kg -1の用量で感染動物を治療できます。この用量には、3 か月間感染を防ぐ予防効果もあります。
DNA の標識に対する臭化エチジウムの有効性は 1965 年に発見され、 1973 年に初めて使用されました。
分子生物学での使用
臭化エチジウム (BEt または EtBr と略称) は、分子生物学研究室で核酸マーカーとして一般的に使用されるインターカレート剤です。紫外線にさらされると赤オレンジ色の蛍光を発し、DNA に結合すると 20 倍強くなります。この効果は、ベンゼン環の剛直化によるものではなく、環境の疎水性の増加によるものと考えられます。ベンゼン環は塩基対の間に位置していません。
最も一般的な用途は、電気泳動による DNA 断片の分離を目的としたゲルの染色です。 BEt はゲルの調製時にアガロースと混合することも、泳動が起こった後にゲルを BEt 溶液に浸漬することもできます。どちらの場合も、最終的な BEt 濃度は約0.5 μg · ml -1です (ストック溶液の濃度は通常10 mg · ml -1です)。ポリアクリルアミドゲル電気泳動の場合、アクリルアミドの重合を阻害するため泳動後にのみ発色します。
エチジウムブロマイドは、塩基間に短い相補的領域を挿入することにより、RNA を着色することも可能にします。ただし、ほとんどの RNA は二本鎖ではないため、同じ質量の場合、RNA の染色の強度は DNA の染色よりも大幅に低くなります。
+ CsCl 2超遠心分離