真核生物 (系統分類)について詳しく解説

導入

このページの目的は、真核生物(真核生物、真核生物) の系統樹、つまり、異なるグループ (または分類群) 間に存在する血縁関係を強調する系統図を提示することです。科学界内で議論の対象となっている論点は、参考文献の前に簡単に示されています。

系統樹

分類群に続いて、その出現時期がわかっている場合は、次の凡例に従って示すことができます。 ( Ple ): 更新世。 (褶曲): 鮮新世。 (みお): 中新世。 (オリ): 漸新世。 ( Éoc ): 始新世。 ( Pal ): 暁新世。 ( Cre ): 白亜紀。 ( Jur ): ジュラ紀。 ( Tri ): 三畳紀。 (当たり): ペルム紀。 (車): 石炭紀。 ( Dev ): デボン紀。 ( Sil ): シルル紀。 ( Ord ): オルドビス紀。 (カンブ):カンブリア紀。さらに、可能であればさらに明確にするために、( – ): 低い。 ( ~ ): 中。 ( + ): 優れています。

▲は生命の系統樹のすぐ上の部分を指します。記号► は、対象となるグループの系統分類を示します。

 ▲ └─oエウカリオタ§─o ウニコンタ │ │ │ §─oアメーボゾア► │ │ │ └─oオピストコンタ► │ lux─o ビコンタ §─? Apusozoa │ §─o DiphyllateaまたはCollodictyonidae │ §─o Hilomonadea │ │ §─o Micronuclearia │ │ └─o Planomonadida │ └─o Thecommonadea │ §─?ヘミマスティゴフォラまたはスピロネミダ科│ §─oアンシロモナダ科│ └─oアプソモナダ科 └─o §─oエクスカヴァタ科► └─o ├─o プランテ科またはアーケプラスティダ科► │ └─oクロムマルヴェオラータ科 ► (側系統?) │ └─oリザリア科►

もっと詳しく知る

参考文献の出典

真核生物全般について

• Sandra L. Baldauf: 「真核生物の系統発生と多様性の概要」、 Journal of Systematics and Evolution 、vol. 46、n°3、2008、pp. 263–273
• ファン・スユン、ジェシカ・グラント、ヨナス・I・テクル、ミン・ウー、ベンジャミン・C・チャオン、ジェフリー・C・コール、ジョン・M・ログスドン・ジュニア、デビッド・J・パターソン、デバシッシュ・バタチャリヤ、ローラ・A・カッツ (2008)真核生物の多重遺伝子ツリー」、 BMC進化生物学、8:14
• Johanna Fehling、Diane Stoecker、Sandra L. Baldauf (2007) 「光合成と真核生物の生命の樹」、PG Falkowski および AH Knoll、 『海の一次生産者の進化』 、エルゼビア、ボストン、pp. 75-107
• Jeremiah D. Hackett、Hwan Su Yoon、Shenglan Li、Adrian Reyes-Prieto、Susanne E. Rümmele、Debashish Bhattacharya (2007) 「系統ゲノム分析は、隠蔽植物とハプト植物の単系統およびリザリアとクロムマルベオラートの関連性を裏付けています」、 Mol.バイオル。進化。 24(8)、pp. 1702 ～ 1713 年
• Fabien Burki、Kamran Shalchian-Tabrizi、Marianne Minge、Åsmund Skjæveland、Sergey I. Nikolaev、Kjetill S. Jakobsen、Jan Pawlowski (2007) 「系統ゲノミクスによる真核生物のスーパーグループの再編」、 PLoS One 2(8): e790
• Laura Wegener Parfrey、 Erika Barbero、Elyse Lasser、Micah Dunthorn、Debashish Bhattacharya、David J. Patterson、Laura A. Katz (2006) 「真核生物の多様性の現在の分類に対するサポートの評価」、 PLoS Genet 2(12): e220
• シーナ・M・アドル、アレステア・GB・シンプソン、マーク・A・ファーマー、ロバート・A・アンダーセン、ロジャー・アンダーソン、ジョン・R・バータ、サミュエル・S・バウザー、ガイ・ブルゲロール、ロバート・A・フェンサム、スザンヌ・フレデリック、ティモシー・Y・ジェームズ、セルゲイ・カルポフ、ポール・クグレン、ジョン・クルーグ、クリストファー・E・レーン、ルイーズ・A・ルイス、ジーン・ロッジ、デニス・H・リン、デヴィッド・G・マン、リチャード・M・マッコート、レオネル・メンドーサ、オイビンド・モエストラップ、シャロン・E・モズリー＝スタンドリッジ、トーマス・A Nerad、Carol A. Shearer、Alexey V. Smirnov、Frederick W. Spiegel、Max FJR Taylor (2005) 「真核生物の新しい高レベル分類」、 J. Eukaryot。微生物。 、５２（５）、ｐ． 399–451
• ファン・ス・ユン、ジェレミア・Ｄ・ハケット、クラウディア・シニリア、ガブリエレ・ピント、デバシシュ・バタチャリヤ（２００４年）「光合成真核生物の起源に関する分子年表」、 Ｍｏｌ．バイオル。進化。 21(5)p. 809-818
• 野崎久義ら（2003）「ミトコンドリア含有真核生物の複数の核遺伝子によって明らかにされた紅藻類の系統発生的位置と色素体の起源に関する代替仮説」、 J. Mol.進化。 56ページ485-497
• Thomas Cavalier-Smith (2002) 「真核生物の貪食的起源と原生動物の系統分類」、国際系統的進化微生物学ジャーナル、52、p. 297–354
• Guillaume Lecointre および Hervé Le Guyader (2001, 2006³)生物の系統分類、Belin、ISBN 2-7011-4273-3
• Sandra L. Baldauf、AJ Roger、I. Wenk-Siefert、WF Doolittle (2000) 「結合タンパク質データに基づく真核生物の王国レベルの系統発生」、 Science (290)、p. 972-977
• Thomas Cavalier-Smith (1998) 「改訂された 6 王国の生命システム」、 Biological reviews 73、p. 203-266
• Thomas Cavalier-Smith (1993) 「原生動物界とその 18 門」、 Microbiological Reviews 57 (4)、pp. 953-994

アプソゾアについて

• トーマス・キャバリア＝スミス、エマ・E・チャオ、アレクサンドラ・ステクマン、ブライアン・オーツ、セルゲイ・ニコラエフ：「プラノモナディダの命令。 11 月 (Apusozoa): Micronuclearia podoventralisとの超微細構造の親和性とPlanomonas属内の深部分岐11 月 »、プロティスト、ボリューム159、n°4、2008、pp. 535-562

その他の参考文献

インターネットソース

• パリ第 7大学の IMVI 修士、ドゥニ・ディドロの真核微生物学コースのウェブサイトにある真核生物の多様性の図解目録
• アレクセイ・B・シプノフ (2008) Systema Naturae
• ミッコの系統学アーカイブ
• 分類学
• Palaeos.org
• Palaeos.com
• 顕微鏡
• NCBI 分類ブラウザ
• 生命の樹 Web プロジェクト
• Effervesciences (CINAPS Television): 今日のダーウィン (ギョーム・ルコアントルと)

内部リンク

• 真核生物門 — 肺胞門 — 古細菌門 — 色素門 — 後生動物門 — 菌門門
• 生き物（系統分類）
• 書誌オリエンテーションシリーズ:
  • 生物の起源と進化 –動物学–植物学、生理学、菌学 – 微生物学
• 植物の世界の分類写真ガイド
• 系統樹
• Guillaume Lecointre と Hervé Le Guyader の系統分類